民國69年,在修整南投紫南宮屋瓦剝落的工程中,一位林姓工人遇到了一場驚奇的事情。當他正當在屋頂前進時拆除工作時,突然發現住梁內竟然有兩條手腕粗的巨蛇。慌亂之下,他快速揮手將其中一條蛇擊暈。
寺廟的人看到後驚呼道:「這是土地公護廟的棟樑蛇,是土地公的護將,不可以用.死.牠!」他們急將昏迷的蛇安置在地球公神座後的靈穴上,而另外一條蛇則不知所踪。
然而,隔天一早,林姓工人突然無法起床,整個人躺在床上動彈不得。他的妻子見狀非常驚慌,而村裡的人則說林男可能惹土地公不高興才會變成這種情況。
林姓工人的妻子急忙拿著牲禮前去紫南宮,希望神明能原諒先生的無心之過。神奇的是,祭拜後不久,林男竟然神奇地康復了。從那之後,紫南宮的「雙蛇護廟」經典故事流傳開來,並與香火更加鼎盛。